Styringen av de nasjonale medisinske kvalitetsregistrene er organisert i en arbeidsgruppe med representanter fra de fire helseregionene
Det interregionale fagdirektørmøtet har styringsgruppeansvaret for kvalitetsregisterfeltet og behandler saker for beslutning av de regionale foretakene. Interregional arbeidsgruppe er rådgivende for styringsgruppen.
Interregional arbeidsgruppe består av leder for Nasjonalt servicemiljø i SKDE, representant med kvalitetsregisterkompetanse fra hver helseregion, leder for Teknologiforum for medisinske kvalitetsregistre og en representant for et nasjonalt medisinsk kvalitetsregister.
Ledelsen av arbeidsgruppen rullerer mellom regionene og Nasjonalt servicemiljø i SKDE er sekretariat.